Pirmoji Švėkšnos evangelikų liuteronų bažnyčia pastatyta 1819 m. (kur dabar stovi Šv. Florijono paminklas), bet 1856 m. ją nusiaubė gaisras. Dabartinė bažnyčia pastatyta 1867 m., 1913 m bažnyčiai pristatytas bokštas.

2005 m. bažnyčią nuniokojo uraganas „Ervinas“. Nuo uragano griaunančios jėgos nukentėjo Švėkšnos evangelikų liuteronų bažnyčia. Stiprus vėjas nudraskė bažnyčios stogą, lietus apliejo ir taip perdrėkusią vakarinę altoriaus sieną. Iš tiesų buvo nelengva žvelgti į nuostabių rankų darbo padarytą altorių, kuris taip negailestingai buvo aplietas vandeniu.

Švėkšnos bažnyčia pastatyta 1867 m. Nuo jos pastatymo stogas dar nebuvo nė kartą restauruotas, todėl neverta stebėtis, kad beveik 150 metų “išgyvenusi” skarda neatlaikė uragano griaunančios jėgos.