Labūnavos parapija įkurta prieš 1799 m., nes tais metais buvo pastatyta pirmoji medinė Labūnavos bažnyčia. Iki tol Labūnava buvo Vandžiogalos parapijos filija. Bažnyčia sudegė Napoleono kariuomenės antpuolio metu. Grafų Zabielų ir parapijiečių bendromis pastangomis
antroji medinė bažnyčia pastatyta 1885 m., kurią 1944 m. rugpjūčio 1 d. per Šv.Onos atlaidus sunaikino padegamosios bombos sukeltas gaisras. Nuo 1945 m. iki dabar pamaldos vyksta grafų Zabielų šeimos kapinių koplyčioje, pastatytoje 1859 m. Buvo pristatyta zakristija, padirbtinti altoriai, suolai. Koplyčia yra viena iš keturių Lietuvoje rotondinio tipo sakralinių pastatų. Labūnavos parapijoje gyvena apie 1200 žmonių.