1989 m. spalio 16 d užregistruota Ignalinos raj. Sniečkaus gyvenvietės katalikų religinė bendruomė bei gautas leidimas pasistatyti naują bažnyčią. Lapkričio 15 d. įkurta Sniečkaus parapija.

Sniečkaus valdžia skyrė patalpas – Profesinės technikos mokyklos bendrabučio 119 kv.m dydžio salę Festivalio g. 9. Parapijiečių rūpesčiu įrengtoje koplyčioje gruodžio 10 d. įvyko pirmosios šv. Mišios. Gruodžio 25 d. Sniečkaus gyvenvietės katalikai pirmą kartą bendrai šventė šv. Kalėdas.

1992 m. lapkričio 2 d. prasidėjo bažnyčios statybos. 1996 m. uždengtas stogas ir per šv. Kalėdas tikintieji, apleidę jau antrą laikiną koplyčią, susirinko naujoje, bet dar neužbaigtoje, bažnyčioje. Bažnyčia užbaigta 1998 m.

Bažnyčios bokšte 2004 m. balandžio 10 d. suskambo iš Vilniaus Arkikatedros Bazilikos varpinės pervežtas apie 1200 kg svorio senovinis varpas. Varpas pritvirtintas prie naujos linguojančios sijos, varpui suprojektuota ir pagaminta nauja šerdis.

2005 m. gautas Vilniaus arkivyskupijos metropolito Audrio Juozo Bačkio leidimas aukotojų bei rėmėjų lėšomis Visagino bažnyčioje pagaminti ir pastatyti vargonus. Laimio Pikučio vargonų firmos įrengti 2 manualų su pedalu, 29 registrų vargonai pirmą kartą sugaudė 2010 m. gruodžio 30 d.