Punios Šv. Apaštalo Jokūbo bažnyčia pastatyta 1863 m., vietoj sudegusios senosios. Jos architektūra – baroko ir klasicizmo junginys. Pirmoji bažnyčia Punioje buvo pastatyta 1425 m. Manoma, kad bažnyčia buvo pastatyta Vytauto Didžiojo paliepimu. Didžiojo kunigaikščio atminimas čia iki šiol gerbiamas. Punios bažnyčioje kabo šio kunigaikščio portretas.
Prie bažnyčios stovi mūrinė koplytėlė, skirta 1831 m. sukilimo dalyviaų atminimui.